对于直肠黏膜的脱垂，用药物来治疗会有一定的效果。取乌梅15克、石榴皮30克、五倍子15克、明矾15克，还有苦参15克，这些药加在一起水煮20分钟，等水温了以后再坐浴，每次坐5～10分钟。坐浴后，将脱垂的直肠还纳到肛内，并配合口服中药、补中益气汤、六味丸、十全大补丸、金匮肾气丸等。
也可以采取注射硬化剂的方法。对于直肠全层的脱垂手术治疗，传统的手术方法是开腹悬吊，效果不错，但是创伤比较大。国内目前多采取经肛门直肠固定术，手术操作主要分成两个部分。
第一、直肠黏膜纵向点状的结扎，这需要在直肠脱垂的时候，在肛门外面操作，结扎直肠壁松弛的黏膜，结扎点要成柱状排列，每柱5～7个结扎点，直肠内总共形成5条结扎的点，构成一个固定的柱。
第二、肛管要进行紧缩，肠腔黏膜脱垂结扎后，将直肠还纳到肛内，在肛门镜下观察，直肠下黏膜隆起钳夹，让其形成一个8字结扎，固定肛管，在肛缘外形成1、5、7、11点四个点位，并向肛门外做放射状的梭形切口，切除皮肤，然后连续缝合关闭切口。注意这种缝合一定要深达肌层，完成后肛管明显的缩小。
