在发生呼吸困难的同时或稍后，有的病雏一侧或两侧眼睑肿胀，羞明，结膜潮红，流泪，结膜囊内有黄白色干酪样凝块，挤压可出，如黄豆瓣大小，严重时眼睑和眼球周围严重肿胀，眼裂闭合，此为霉菌性眼炎。
此外，一部分雏鸡发生运动失调，步态不稳，头颈偏斜等神经症状，此即霉菌性脑炎。
较大日龄或青年鸡发病时症状不明显，多为散发，可见张口喘气，冠髯暗红，有时颈部和面部皮下有大枣或核桃大肿瘤样结节(实为霉菌性肉芽肿)。多在死亡后剖检时才发现，此型病程很长，可达3～4个月。
最为常见的病变是肺、气囊、胸膜腔浆膜上有从大头针帽至小米粒大小的霉菌结节，呈灰白色或黄白色，气囊膜变厚、浑浊。肺上有多个结节，使肺组织质地变硬，弹性消失，结节呈灰白色或淡黄色，柔软有弹性，内容物呈干酪样。有的结节可互相融合成大的团块。在气囊或腹腔浆膜上用肉眼即可见到成团的霉菌斑，呈圆形，隆起如盘状，有的中心呈灰绿色。(图片来源：视觉中国)
