按使用材料分类
根据箱子主体部件（侧壁、端壁、箱顶等）采用什么材料，就叫做什么材料制造的集装箱，按使用材料分类，集装箱可分成三种：
（1）铝合金集装箱，优点是重量轻，外表美观，防腐蚀，弹性好，加工方便以及加工费、修理费低，使用年限长；缺点是造价高，焊接性能差；
（2）钢制集装箱，优点是强度大，结构牢，焊接性高，水密性好，价格低廉；缺点是重量大、防腐性差；
（3）玻璃钢制集装箱，优点是强度大，刚性好，内容积大，隔热、防腐、耐化学性好，易清扫，修理简便；缺点是重量大，易老化，拧螺栓处强度降低。
按结构分类
按结构分类集装箱可分为三类：
（1）内柱式与外柱式集装箱，主要指铝合金集装箱，内柱式集装箱是指侧柱（或端柱）位于倒壁或端壁之内；外柱式集装箱是指侧柱（或端柱）位于倒壁或端壁之外；
（2）折叠式集装箱，指集装箱的主要部件（侧壁、端壁和箱顶）能简单地折叠或分解，再次使用时可以方便的再组合起来；
（2）薄壳式集装箱，是把所有部件组成一个钢体，它的优点是重量轻，可以适应所发生的扭力而不会引起永久变形。
按使用目的分类
1普通集装箱
普通集装箱，又称干货集装箱以装运件杂货为主，通常用来装运文化用品、日用百货、医药、纺织品、工艺品、化工制品、五金交电、电子机械、仪器及机器零件等。这种集装箱占集装箱总数的70 ~ 80%。除了冷冻货、活的动物、植物之外，在尺寸、重量等方面适合集装箱运输的货物，均可使用干货集装箱。
2冷冻集装箱
冷冻集装箱分外置和内置式两种。温度可在-60℃~ +30℃之间调整。内置式集装箱在运输过程中可随意启动冷冻机，使集装箱保持指定温度；而外置式则必须依靠集装箱专用车、船和专用堆场、车站上配备的冷冻机来制冷。
3开顶集装箱
适合于装载玻璃板、钢制品、机械等重货。
4框架集装箱
框架集装箱没有箱顶和两侧，其特点是从集装箱侧面进行装卸。
5牲畜集装箱
牲畜集装箱这种箱子侧面采用金属网，通风条件良好，而且便于喂食。是专为装运牛、马等活动物而制造的特殊集装箱。
6罐式集装箱
罐式集装箱又称液体集装箱。是为运输食品、药品、化工品等液体货物而制造的特殊集装箱。其结构是在一个金属框架内固定上一个液罐。
7平台集装箱
平台集装箱形状类似铁路平板车，是具有高承载能力的底板而且没有上部结构的集装箱。
8通风集装箱
通风集装箱，箱壁设有4-6个通风孔，内壁涂塑料层，适宜装新鲜蔬菜和水果等怕热怕闷的货物。
9保温集装箱
保温集装箱，箱内有隔热层，箱顶又有能调节角度的进出风口，可利用外界空气和风向来调节箱内温度，紧闭时能在一定时间内不受外界气温影响。适宜装运对温湿度敏感的货物。
10散装货集装箱
散装货集装箱，一般在顶部设有2~3个小舱口，以便装货。底部有升降架，可升高成40°的倾斜角，以便卸货。这种箱子适宜装粮食、水泥等散货。
11散装粉状货集装箱
散装粉状货集装箱与散装箱基本相同，但装卸时使用喷管和吸管。
12挂式集装箱
挂式集装箱适合于装运服装类商品的集装箱。 随着国际贸易的发展，商品结构不断变化，今后还会出现各种不同类型的专用或多用集装箱
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