近日,首都医科大学附属北京地坛医院张福杰教授团队基于清华大学郭永研究员团队研发的微液滴数字PCR (ddPCR)技术,比较了ddPCR与实时荧光定量PCR(RT-PCR)在新冠病毒检测中的应用,并利用ddPCR 评估了SARS-CoV-2病毒载量在不同样本中的差异以及在疾病进程中的动态变化。
研究发现,痰标本更能反映体内病毒复制水平,定量监测下呼吸道样本的病毒载量有助于评估疾病进程。
该研究结果于3月28日在 Clinical Infectious Diseases 上发表。第一作者是于凤婷、闫力婷、王楠,通讯作者是北京地坛医院张福杰教授和清华大学研究员郭永教授。
(地坛医院科研人员在P2+实验室进行核酸检测)
目前,我国及世界各国将定性核酸检测作为COVID-19病原学诊断的金标准。然而,但出现了在临床和流行病学高度疑似的病例中核酸检测阴性的问题,也有确诊患者出院2周后复查发现核酸“复阳”的报道。
因此,核酸检测在COVID-19诊断中的作用需要进一步研究。
该研究对来自76位确诊患者的323份样本(鼻拭子55份、咽拭子134份、痰116份,尿14份,血4份)同时进行RT-PCR与ddPCR配对检测,得到了一些新发现。
发现一:ddPCR在低病毒载量的检测中更有优势且能给出样本中的病毒载量数值。
发现二:痰标本平均病毒载量高于咽拭子和鼻拭子。利用ddPCR分析不同组织样本的病毒载量,发现痰标本的平均病毒载量显著高于咽拭子和鼻拭子,表明痰更能反应体内病毒复制水平。
发现三:痰液中病毒含量早期和进展期显著高于恢复期。进一步用44位确诊患者的116份痰标本分析病毒载量在疾病进程中的变化,发现在疾病早期和进展期平均病毒载量显著高于恢复期。因此,早期诊断并采取隔离措施有助于减少传播和控制疾病。
发现四:采集不当或使用上呼吸道标本在核酸转阴前极易出现“假阴性”。通过对2位临床表现和胸部CT提示进入恢复期的患者进行9天的动态观察,分别检测6次和7次痰标本,发现在核酸转阴之前较长时间处于无症状低病毒载量携带状态,提示这一阶段取样方法不当或采集上呼吸道样本极易出现检测“阴性”的结果,多次下呼吸道样本及不同方法的检测有助于提高灵敏度。
目前,COVID-19尚无有效的抗病毒治疗药物,在正在进行和即将进行的抗病毒药物临床试验中,ddPCR定量检测可能对药物疗效评价具有重要指导意义。
(科研人员走出实验室做出胜利手势)
论文链接:
https://doi.org/10.1093/cid/ciaa345
.Fengting Yu,Liting Yan, Nan Wang,et al. QuantitativeDetection and Viral Load Analysis of SARS-CoV-2 in Infected Patients. ClinInfect Dis 2020.
来源:北京地坛医院
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